Η γαστροσκόπηση είναι ασφαλής, ανώδυνη, και σύντομη εξέταση (διαρκεί μερικά λεπτά).
Διενεργείται για τη διερεύνηση συμπτωμάτων του ανώτερου πεπτικού συστήματος όπως τα ανώτερα κοιλιακά άλγη, η ναυτία, ο εμετός, η δυσκολία στην κατάποση, οι ξινίλες, τα ρεψίματα και η δυσκολία να χωνέψει κανείς εύκολα. Αυτά τα συμπτώματα μπορεί να οφείλονται σε κάποια πάθηση του οισοφάγου, του στομάχου ή του δωδεκαδακτύλου. Είναι ασφαλής και η καλύτερη μέθοδος εξέτασης για τα πιο πάνω συμπτώματα γιατί δίνει τη δυνατότητα ακριβούς διάγνωσης και επιβεβαίωσής της με λήψη βιοψιών όταν ενδείκνυται.
Αποτελεί επίσης, την καλύτερη εξέταση για την ανεύρεση της αιτίας της αιμορραγίας στο ανώτερο πεπτικό σύστημα. Με την βοήθεια της γαστροσκόπησης μπορούν επίσης να γίνουν θεραπευτικές παρεμβάσεις όπως έλεγχος αιμορραγίας (γαστρορραγία), αφαίρεση ξένου σώματος από το στομάχι (οδοντοστοιχία, κέρματα κ.α.), αφαίρεση πολυπόδων κτλ.
Τέλος με την βοήθεια της γαστροκόπησης μπορούμε ακόμη να πραγματοποιήσουμε πιο πολύπλοκες θεραπευτικές επεμβάσεις, όπως να αποκαταστήσουμε μια στένωση στον οισοφάγο με την τοποθέτηση ενός μεταλλικού σωλήνα (stent) με την μορφή πλέγματος, διαστολή στενώσεων με μπαλονάκι, διενέργεια γαστροστομίας κ.λ.π.
Τα νεότερης τεχνολογίας ενδοσκόπια Fujifilm Eluxeo 700 τα οποία χρησιμοποιούμε βοηθούν πολύ στην ανίχνευση ακόμη και πολύ μικρών βλαβών.